Descubren nuevas bacterias y virus en la piel humana.

Un equipo internacional de científicos, descubren «miles de secuencias virales» y decenas de bacterias y hongos previamente desconocidos en la piel humana.

Los microbiomas (comunidades de microorganismos) se encuentran en todas partes, desde los océanos y el suelo hasta el intestino humano y la superficie de la piel. 

Ciertos microorganismos en el microbioma de la piel están asociados con diferentes afecciones de la piel, incluidos el acné y el eccema.

En un estudio publicado en la revista Nature Microbiology, los investigadores secuenciaron los genomas de los microorganismos detectados en 594 muestras tomadas de varias superficies de piel de 12 voluntarios sanos. 

Combinando el cultivo de laboratorio tradicional con un enfoque de secuenciación metagenómica, los investigadores pudieron crear Skin Microbial Genome Collection (SMGC), una colección de genomas de referencia para el microbioma de la piel humana.

Diversidad en el microbioma de nuestra piel

«Descubrimos miles de secuencias virales, incluidos muchos fagos gigantes, virus muy grandes que infectan bacterias, más comúnmente en la superficie de las manos y los pies de nuestros voluntarios», dijo Sara Kashaf, estudiante de doctorado en los NIH y EMBL-EBI. 

«Estas áreas del cuerpo tienen microbiomas muy diversos, lo que tiene sentido porque constantemente usamos nuestras manos para tocar cosas nuevas en nuestro entorno. Nuestro trabajo futuro tendrá como objetivo comprender qué están haciendo estos diferentes microbios dentro de estas comunidades».

Los investigadores utilizaron métodos de cultivo de laboratorio extensivos, secuenciación metagenómica y metagenomas de piel disponibles públicamente para obtener estos nuevos conocimientos sobre el alcance de la diversidad dentro del microbioma de la piel. 

Este estudio se centró principalmente en individuos de América del Norte, pero el trabajo futuro tendrá como objetivo expandir el SMGC utilizando muestras de diferentes poblaciones.

Nuevos eucariotas, bacterias y virus

La colección de SMGC incluye 174 especies bacterianas previamente desconocidas, cuatro nuevos eucariotas y 20 nuevos fagos jumbo: virus con un genoma de más de 200 kilobases, de 3 a 5 veces más grande que un virus promedio. 

Los investigadores han estado trabajando anteriormente con un conocimiento incompleto de la composición bacteriana del microbioma de la piel. Sin embargo, esta investigación amplía el catálogo de bacterias cutáneas conocidas en un 26%.

Todos estos datos estarán disponibles de forma gratuita en un nuevo catálogo de genomas en el recurso de datos MGnify, donde los investigadores pueden encontrar una amplia gama de conjuntos de datos de microbiomas, incluso para el intestino humano.

Mayor información: Sara Saheb Kashaf, Diana M. Proctor, Clay Deming, et al. «Integrating cultivation and metagenomics for a multi-kingdom view of skin microbiome diversity and functions». Nature Microbiology. Published: 24 December 2021.

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